Разговорное. Экспрессивное.
Очень маленький: невысокого роста или малолетний.
Он был совсем ещё маленький, мальчик с пальчик, в надвинутом до самого носа картузе и привык во всем подчиняться девочкам из флигеля (Саша Чёрный. Кавказский пленник).
Современный контекст:
Увидишь такого карапуза, выглядывающего из травы, потянешься за ним, а чуть поодаль ещё один «мальчик с пальчик», а то и несколько (Мойнов С. Грибные портреты // Наука и жизнь. 2008).